Il semble qu'il y ait un manque de clarté et probablement une sorte de combinaison de plusieurs facteurs.
L'article La transplantation de microbiote fécal dans une infection Clostridium difficile récidivante mentionne deux théories pour expliquer son efficacité (et son bon fonctionnement) :
- L'introduction de bactéries capables de concurrencer le C. difficile rééquilibre le microbiote fécal - dans des circonstances normales, la MC est en concurrence avec d'autres bactéries (pas toujours assez pour disparaître, elle peut être trouvée chez environ 1 personne saine sur 30 , mais suffisamment pour ne pas poser de problème), et elle ne peut se développer qu'après l'utilisation d'antibiotiques. Une FMT réintroduit ses concurrents
- L'introduction de la “nouvelle” bactérie entraîne une réponse immunitaire qui aide à éradiquer C. difficile
Le premier mécanisme est celui que j'ai trouvé mentionné dans quelques autres sources également, par exemple sur OpenBiome :
Bien que le mécanisme reste à déterminer, on pense que la FMT fonctionne en repeuplant le microbiome du patient avec divers micro-organismes qui excluent de manière compétitive C. difficile
Une autre hypothèse est que la composition acide des fèces est significativement altérée et inhibe la croissance de la CD, voir [ Les changements de la composition des acides biliaires du côlon suite à une transplantation de microbiote fécal sont suffisants pour contrôler la germination et la croissance de Clostridium difficile (http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0147210).